شرکت فرابورس ایران موفق به دریافت گواهینامه ISO 9001:2008 شد. این گواهینامه پس از ممیزی شرکت توف‌نورد آلمان و با بررسی‌های به عمل آمده در راستای پیاده‌سازی سیستم مدیریت در پیروی از استاندارد بالا برای ارائه خدمات مالی در زمینه درج و پذیرش شرکت‌ها به منظور انجام معاملات اوراق بهادار و نظارت بر انجام این معاملات و نظارت بر امور مربوط به کارگزاری‌ها به فرابورس ایران تعلق گرفت. گواهینامه ایزو 9001 ورژن 2008 فرابورس ایران، تا چهارم شهریور 1396 اعتبار دارد و سالانه با ممیزی‌های مراقبتی موسسه توف‌نورد مورد بازنگری قرار می‌گیرد.

گفتنی است استاندارد ایزو 9001 یکی از استانداردهای سیستم مدیریت کیفیت است که این استاندارد پس از پیاده‌سازی و اجرا در هر سازمانی افزایش رضایت و اعتماد مخاطبان، کاهش دوباره‌کاری‌ها، طراحی و ارائه بهتر خدمات، بهبود مستمر فرآیندها، بهره‌وری و غیره را به همراه دارد و فرابورس ایران در راستای بیانیه رسالت و اهداف خود به استقرار و پیاده‌سازی نظام مدیریت کیفیت از طریق ایزو اقدام کرده است.