طرح های فناورانه مساله محور و جریان سازی که نیازمند همکاری و هم افزایی بخش های مختلف است با مشارکت دستگاه های مرتبط، تجاری سازی می شود.
قانون جهش تولید دانش بنیان دستگاه ها را موظف کرده تا برای حمایت از این طرح ها به میدان بیایند و با استفاده از همه ظرفیت های خود؛ زمینه اجرایی شدن این طرح ها را با کمک دیگر دستگاه ها و با استفاده از توان دانشی دانشگاه ها فراهم کنند.
آیین نامه ابلاغی هیات وزیران هم با تاکید بر همین موضوع، وزارت علوم، تحقیقات و فناوری را مکلف کرده تا زمینه لازم برای اجرای طرح های فناورانه پرچمدار و جریان ساز که طرح هایی مساله محور و با قابلیت تجاری سازی هستند و اجرای آنها نیازمند مشارکت گسترده بازیگران مختلف است را فراهم کند.
در این آیین نامه تاکید شده است که این برنامه با راهبری و هدایت وزارت علوم، تحقیقات و فناوری، صندوق شورای عالی و سایر دستگاه های اجرایی ذیربط به ویژه معاونت علمی و فناوری ریاست جمهوری و صندوق نوآوری و شکوفایی در دانشگاه ها، پژوهشگاه ها و پارک های علم و فناوری و بر اساس ماموریت آنها عملیاتی شود.
وزارت خانه پس از نهایی سازی مجریان و بهره برداران طرح های پیشنهادی و نحوه تامین مالی آن، طرح ها را برای تصویب و بهره مندی از منابع مالی به صندوق شورای عالی و شورای راهبری فناوری ها و تولیدات دانش بنیان ارائه کند.